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截至2014年10月，学校与昆明植物研究所合作，在学校设立丽江高山植物标本馆、高山资源植物联合研究实验室;与丽江花花色玫瑰庄园有限公司合作，开展玫瑰花繁育及产品研发等工作;与丽江老君山国家公园管理局合作，开展“构建丽江老君山国家公园的生态文化体系”及“国家公园遗产保护与社区可持续发展”等研究。

截至2010年2月，学校承担国家、省、市(厅)科研立项课题8项，有校级研究课题20项，学校教师出版专著、教材和其他著作近80部，发表学术论文300多篇、作品100多篇，有99篇论文、作品入选文集，97件成果获奖。

2015年，学校杨琦博士的《跨境贸易人民币结算研究》荣获云南省哲学社会科学优秀成果奖著作类三等奖;木春燕教授的《城市化进程中的丽江城郊少数民族妇女》荣获云南省哲学社会科学优秀成果奖优秀成果论文类三等奖。

  2014年，学校杨琦博士的《农业产业化中的农业保险经营模式》荣获云南省哲学社会科学优秀成果奖优秀成果著作类三等奖。