教育部直属大学毕业的研究生有优势吗

这个不一定。教育部直属院校毕业的研究生未必有什么优势。第一，教育部直属院校之外，还有其他部委直属院校、军队院校，教育部直属院校未必就比人家强。比如北京科技大学是教育部直属院校，但是知名度和实力就不如哈尔滨工业大学。第二，就算是地方院校，人家也有自己的特色专业。比如教育部直属院校的厦门大学，这个不光是教育部直属，还是985/副部级院校，但是他的医学专业就不如中国医科大学、天津医科大学这样的地方院校。因此，必须看具体专业、具体院校。